Muzej će se pojaviti u ulici Valovaja, u blizini kanala Raduni - u slikovitom i nenatrpanom uglu Starog grada. Ovo mjesto je izuzetno značajno i za poljsku i za evropsku historiju. U blizini predratnog razdoblja, kada je Gdansk nosio ime "Slobodni grad Danzig" i bio neutralna teritorija pod kontrolom Lige nacija, nalazi se poljska pošta. U međuratnom periodu bila je jedna od dvije poljske državne institucije u gradu (druga je bila Vojno tranzitno skladište na poluostrvu Westerplatte). Stoga je pošta 1. septembra 1939. godine, prvog dana Drugog svjetskog rata, postala jedan od glavnih ciljeva nacističkih trupa i, uprkos herojskom otporu poštanskih službenika (neki su poginuli u borbi ili kasnije umrli od rana, ostale su pogubili nacisti), zarobili su ih. Sada se u zgradi, zajedno s poštom, nalazi muzej, a obližnji trg je dobio ime po braniteljima poljske pošte. Muzej Drugog svjetskog rata, koji bi trebao biti otvoren 2014. godine, godine 75. godišnjice svog početka, dopunit će ovo spomen mjesto.
Odluku o tome koji je projekt muzeja vrijedan provedbe donijeli su predsjednik žirija, zamjenik gradonačelnika Gdanjska Wieslaw Bielawski, poljski arhitekti Grzegorz Bucek, Wieslaw Chabanski i Wieslaw Gruszkowski, predstavnici međunarodne arhitektonske zajednice Daniel Libeskind, Hans Stiman i George Ferguson, kao i povjesničar Wojciech Duda, direktor Londonskog muzeja, britanskog Poljaka Jack Lohman i dizajner Andrzej Pongowski. Članovi žirija pregledali su ukupno 240 projekata iz 33 zemlje.
Nagrade su dodijeljene sedam učesnika koji su dijelili nagradni fond od 200 hiljada eura. Tri glavne nagrade odnijeli su biro Kwadrat (njegov projekt će biti implementiran), poljska radionica Piotr Płaskowicki & partnerzy, odnosno grčki arhitekti Betaplan. Takođe su novčane nagrade dobili bugarski, turski i dva poljska zavoda.
U proljeće 2010. godine, službena web stranica budućeg muzeja objavila je apel Donalda Tuska konkurentskim arhitektima. Poljski premijer sugerirao je da će "koncept muzeja i njegov daljnji razvoj u velikoj mjeri ovisiti o arhitektonskoj formi." Tako se i dogodilo: Jacek Droszcz, šef studija Kwadrat, zaista je u svom radu uspio djelomično predodrediti odluku muzejske postavke. U intervjuu za poljske novine Gazeta Wyborcza Trojmiasto, govorio je o simbolici svoje verzije muzeja: budući će posjetitelji pregledati izložbu, počevši od podzemnog dijela ("to je poput pakla generiranog ratom") i završavajući s toranj s pogledom na panoramu obnovljenog grada Gdanjska. Vrijeme i prostor su ovdje temeljne kategorije. Zastrašujuće putovanje kroz vrijeme započinje u tamnici; posjetitelj muzeja vraća se modernosti tek nakon podizanja na tlo. Kula na kraju izložbe simbolizira budućnost koja zamjenjuje prošlost i sadašnjost.
Žiri je primijetio da zgrada, koju je dizajnirao studio Kwadrat, čini posjetitelja osjećajem užasa rata, ali, istovremeno, ne oduzima mu nadu u budućnost. Složena tema, prema mišljenju stručnjaka, ispravno je otkrivena. Vrijednost zgrade poboljšana je zbog njene svestranosti; tako da je toranj muzeja potpuno konstruktivan izum: postat će prekrasna osmatračnica. Prostor muzeja stvoren je ne samo da govori o prošlosti, već je, u jednakoj mjeri, postao mjesto zabave za stanovnike i goste modernog Gdanjska.
Zanimljivo je primijetiti da se na samu činjenicu izgradnje muzeja u početku gledalo dvosmisleno. Na primjer, predstavnik regionalne zaštite spomenika, Marian Kwapiński, izrazio je zabrinutost zbog zaštite povijesne zone grada, ali uspješan projekt uspio je otkloniti sve sumnje.
Arhitekti drugoplasiranog Piotra Plaskowickog i partnerzyja rekli su da je njihov muzej više "anti-zgrada". Prema njihovom projektu, na obali kanala nalazi se masivan duboko crveni zid sa oštrim zubima na vrhu, pored njega je paralelepipedni paviljon koji mu je u kontrastu. Ova dva elementa međusobno su odvojena natkrivenim prostorom - pješačkim šetalištem. Ovaj projekat nije ništa manje simboličan od osvajača prvog mjesta. Žiri je u njemu vidio preokret povijesnih razdoblja - vojnog i modernog, priče o razaranju i oživljavanju.
Ideja radionice Betaplan temelji se na pravougaoniku podijeljenom u nekoliko fragmenata. Izmislili su novi oblik, stavljajući dijelove originalnog pravougaonika nasumičnim redoslijedom na međusobnu udaljenost. Rezultat su zgrade, povezane zajedničkim preklapanjem, čineći platformu: posjetitelji se na nju mogu popeti. Žiri je Muzej grčkog biroa visoko cijenio zbog činjenice da su njegovi autori uspjeli „osjetiti“Gdanjsk i uspješno uklopiti zgradu u gradski pejzaž. No, to se pokazalo nedovoljnim, jer je ova opcija dosegla samo urbane razmjere, a organizatori od budućeg muzeja žele napraviti istinski nacionalnu, pa čak i sveevropsku instituciju.
Prema Gazeta Wyborcza Trojmiasto, 4. januara 2011. usvojena je rezolucija o financiranju projekta Muzeja Drugog svjetskog rata. U njegovu izgradnju i uređenje potrošiće se 358 miliona zlota (oko 120 miliona dolara). Danas se muzej smatra prioritetnom zgradom: to znači da će mu se čak i u teškom postkriznom vremenu dati prioritetna pažnja, jer će muzej posvećen ratu i dalje biti povezan s prevladavanjem prepreka na bilo koji način i oživljavanjem.
